Genom kommunen går tre av Storstockholms gröna kilar: Rösjökilen, Angarnskilen och Bogesundskilen.
Skogarna är till stora delen unga och jämnåriga men har ett högt värde för rekreation och friluftsliv.
Våtmarkerna i Täby innehåller många hotade eller hänsynskrävande växt- och djurarter t ex sumpviol vid Mörtsjön och dvärgbjörk på Fågelsångsmossen Våtmarkerna vid Mörtsjön – Käringsjön är en av kommunens mest värdefulla livsmiljöer för både växter och djur.
Odlingslandskapet kännetecknas av låglänt åker och kuperade beteshagar med öppna eller lövklädda åkerholmar. Täby är rikt på fornlämningar. På många ställen syns stensträngar, spår av forntida indelning av odlings- och betesmarker. De betade torrbackarna vid Skålhamra kvighage och Prästgårdsmarkerna tillhör länets mest värdefulla hagmarker med ett antal hävdberoende och sällsynta växtarter.
I kommunen finns ett naturreservat Rönninge by - Skavlöten och två Natura 2000-områden, Prästgårdsmarkerna och Mörtsjön- Käringsjön med mellanliggande våtmarker. Kommunens enda fågelskyddsområde finns på ön Råholmen i Stora Värtan.
I Täby finns 24 nyckelbiotoper främst lokaliserade i ett stråk från Rönninge by-Skavlötens naturreservat och norrut mot Fågelsången, öster och sydöst om Gullsjön samt vid Mörtsjön – Käringsjön – Fjäturen.